Comunidades Científicas

El Observatorio Virtual (VO por sus siglas en inglés) es una iniciativa de carácter internacional que nació en el año 2000 y cuyo objetivo es optimizar la explotación científica de los cientos de miles de datos existentes en los archivos astronómicos. La Alianza del Observatorio Virtual Internacional (IVOA) engloba una veintena de países, entre ellos España, que se sumó en 2004. El Observatorio Virtual proporciona a la comunidad científica archivos estandarizados, una nueva metodología de investigación y unas potentes herramientas de análisis. El responsable del VO es el Centro de Astrobiología, centro del CSIC. El VO permite tanto la consulta de los datos de los archivos del centro de datos astronómicos como la publicación de nuevos catálogos.

El Instituto Nacional de Oceanografía (IEO) es un organismo público de investigación adscrito al Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades que forma parte de la infraestructura de datos marinos distribuida SeaDataNet (SND), para la gestión de grandes volúmenes de datos diversos derivados de los mares y océanos.
La SDN da acceso a datos e información útil a investigadores, particulares, empresas, importantes iniciativas europeas como EuroFleets (Nuevos pasos operativos hacia una alianza de flotas de investigación europeas) e iniciativas internacionales como POGO (Partnership for Observation of the Global Oceans). Los datos pueden ser de libre acceso (el usuario solo necesita estar registrado en SDN) o estar sujetos a una moratoria de acceso o licencias y podría requerirse un acuerdo específico o un proyecto de investigación. Todos los servicios de información (metadatos) utilizan formatos XML y esquemas XSD, basados ​​en ISO-19115. También utilizan los vocabularios comunes desarrollados en el propio proyecto y el directorio EDMO (European Directory of Marine Organizations). Esto proporciona la coherencia semántica necesaria para que toda la información disponible sea comparable, independientemente del buque, país de origen o área de investigación.
IEO está adaptando su Infraestructura de Datos Espaciales (IDEO) a los principios FAIR siguiendo los principios de INSPIRE. IDEO, a través de un Geoportal de datos marinos, proporciona un catálogo de metadatos y un visor de información marina base totalmente actualizado, mostrando información georreferenciada adquirida y recopilada por el IEO del área marina española en el marco de los diferentes proyectos de investigación en los que participa, como así como en la evaluación inicial y desarrollo de los programas de seguimiento para el cumplimiento de la Directiva Marco sobre la Estrategia Marina (FDMS-2008/56 / CE).

El Instituto Nacional de Bioinformática de España (INB) gestiona ELIXIR, una de las infraestructuras de investigación distribuidas relacionadas con la Salud de España. ELIXIR está concebida como una plataforma tecnológica de bioinformática del Instituto de Salud Carlos III (ISCIII) basada en 19 nodos distribuidos en 13 instituciones y coordinados por un nodo central (https://inb-elixir.es). INB es responsable en ELIXIR de la cogestión del Archivo Europeo de Genomas y Fenomas. La plataforma de INB ofrece a la comunidad de ciencias de la vida nacional e internacional una serie de servicios integrados y recursos bioinformáticos básicos de clase mundial, evolucionando para aprovechar la computación en la nube para escalar a grandes flujos de trabajo de procesamiento de datos.

LifeWatch ERIC es un consorcio europeo de infraestructura (ERIC por su nombre en Inglés) que proporciona una infraestructura de investigación para la e-ciencia a científicos que buscan aumentar el conocimiento y profundizar la comprensión de la organización de la biodiversidad y las funciones y servicios de los ecosistemas para ayudar a la sociedad civil a abordar desafíos planetarios. LifeWatch ERIC es un proveedor de contenido y servicios para la comunidad de investigación en biodiversidad que ofrece nuevas oportunidades para el desarrollo científico a gran escala, facilita la captura de datos acelerada con nuevas tecnologías innovadoras y apoya la toma de decisiones basada en el conocimiento para la gestión de la diversidad biológica y los ecosistemas, ofreciendo además programas de formación, difusión y sensibilización.
LifeWatch ERIC fue establecido como un consorcio europeo de infraestructura de investigación por la Decisión de Ejecución (UE) 2017/499 de la Comisión Europea de 17 de marzo de 2017. La participación en LifeWatch ERIC es a nivel de países u organizaciones intergubernamentales y tiene su sede central y oficina técnica de la e-Infraestructura en España.

Instruct es la infraestructura europea de investigación en biología estructural. Es una de las 48 que forman parte de la hoja de ruta del Foro Estratégico Europeo para las Infraestructuras de Investigación (ESFRI, en sus siglas en inglés). Estas grandes infraestructuras científicas internacionales constituyen la columna vertebral del Espacio Europeo de Investigación y son motor del desarrollo económico de los países involucrados en su construcción, favoreciendo la creación de economías más competitivas e impulsando la recuperación económica en momentos de crisis.
España participa en INSTRUCT-ERIC a través del Centro Nacional de Biotecnología (CNB), perteneciente al Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC), con el Proyecto I2PC (Instruct Image Processing Center). Se trata de la única contribución española a la infraestructura INSTRUCT-ERIC y es un compromiso de Gobierno, a través del Ministerio de Ciencia, Innovación y Universidades.
La Unidad de Biocomputación y el Centro de Procesamiento de la Imagen del CNB apoyan a los biólogos estructurales mediante varias líneas de actuación:
a) Proporcionando soporte personalizado para el procesamiento de imágenes de microscopía electrónica o de rayos X.
b) Promoviendo normas orientadas hacia la estandarización, simplificación y fiabilidad en el procesamiento de imágenes.
c) Desarrollando el software Scipion, que permite el procesamiento completo de las imágenes del microscopio hasta la obtención de los mapas 3D de representación de las estructuras moleculares.
Realizando cursos de capacitación tanto para usuarios de Scipion como para desarrolladores.

EOSC-Life brings together the 13 Biological and Medical ESFRI research infrastructures (BMS RIs) to create an open collaborative space for digital biology. It is our joint response to the challenge of analysing and reusing the prodigious amounts of data produced by life-science. Managing and integrating this data is beyond the capabilities of most individual end-users and institutes. By publishing data and tools in a Europe-wide cloud EOSC-Life aims to bring the capabilities of big science projects to the wider research community. Federated user access (AAI) will allow transnational resource access and authorisation. EOSC-Life establishes a novel access model for the BMS RI: through EOSC scientists would gain direct access to FAIR data and tools in a cloud environment available throughout the European Research Area.
EOSC-Life will make BMS RIs data resources FAIR and publish them in the EOSC following guidelines and standards (e.g. EDMI). Overall this will drive the evolution of the RI repository infrastructure for EOSC and integration of the BMS RI repositories. EOSC-Life will implement workflows that cross disciplines and RI boundaries and address the needs of interdisciplinary science. Through open hackathons and bring-your-own-data events we will co-create EOSC-Life with our user communities , providing a blueprint for how the EOSC supports wide-spread and excellent data-driven life science research. EOSC-Life will address the data policies needed for human research data under GDPR. Interoperable provenance information describe history of sample and data to ensure reproducibility and adherence to regulatory requirements.
The goal of the EOSC-Life project is to make sure that life-scientists can find, access and integrate life-science data for analysis and reuse in academic and industrial research. EOSC-Life will transform European life-science by providing an open, continent-scale, collaborative and interdisciplinary environment for data science.

EOSC-SYNERGY has identified ten thematic services addressing four scientific areas (Earth Observation, Environment Biomedicine and Astrophysics). Those thematic services are heterogeneous, addressing a wider range of requirements, maturity level, user targets and usage models. In the area of Earth Observation, services address the monitoring of coastal changes and inundations, the processing of satellite image data and the estimation of forest mass, addressing different types of targets. In Environment, the thematic service cover the monitoring and protection of ozone, the forecast of sand and dust storms, the simulation of water network distribution and untargeted mass-spectrometry analysis for toxics. In Astrophysics, the project aims at setting up an European service for the Latin American Giant Observatory and in biomedicine EOSC-SYNERGY covers the benchmarking of Genomic data processing tools and the processing of Cyron-electron microscopy imaging.